Prof. Ziejka w latach 1990-1993 był dziekanem Wydziału Filologicznego UJ, następnie prorektorem UJ, a w latach 1999-2005 sprawował funkcję rektora UJ.
Prof. Franciszek Ziejka, emerytowany profesor Wydziału Polonistyki (do roku 2005 profesor Wydziału Filologicznego) odszedł w dniu 19 lipca 2020 r.
Pełny życiorys Profesora, wpisy do księgi kondolencyjnej, a także fotoreportaż z uroczystości pogrzebowych znajdują się na stronach Portalu UJ.